Első System of a Down című albumuk 1998. június 30-án jelent meg, nem túl sok sikerrel. Ugyanakkor sajátos stílusuk és háborúellenes megnyilvánulásaik már itt is felfedezhetők. A dalszövegek sokszor átvitt jelentéstartalommal bírnak, ám szókimondó szövegekkel is találkozunk (War?, P.L.U.C.K).

Az igazi áttörést a második albumuk, a Toxicity jelentette, ami 2001. szeptember 4-én jelent meg a Sony gondozásában, és egyből az első helyen kezdett az amerikai és a brit slágerlistákon. Az album többszörös platinalemez lett. Hangzásvilágában ez az album is eltér az elsőtől, ám mégsem olyan markánsan, mint a Mezmerize/Hypnotize.

Harmadik albumuk a 2002. november 26-án kiadott Steal This Album! nem hozott akkora sikert, mint a Toxicity, de így is jelentős számban kelt el. A lemez a Toxicity-ből lemaradt számokat tartalmazta, de néhány új szám is rákerült az albumra, mint pl. a Roulette.

2005 májusában jelent meg a következő albumuk, a Mezmerize, ami egy dupla-lemez (Mezmerize/Hypnotize) első része. Ez az album hangzásában teljesen eltér az előzőktől. Az album nagyrészén Serj helyett Daron énekel (aki eddig inkább csak háttérénekes volt) és Serj legtöbbször csak háttérénekes. Daron azt nyilatkozta, azért lett más ez az album, mert más oldalukról is meg akartak mutatkozni és nem azt akarták csinálni, mint eddig. Az album megosztotta a rajongókat, de egyből az eladási listák élén nyitott. A lemez leginkább az iraki háborúról és ennek ellenzéséről szól (Daronnak rokonai vannak Irakban).

A Hypnotize a SOAD legújabb albuma, ami a Mezmerize kiegészítése. A duplalemez második része 2005 novemberében került a boltokba. Keményebb hangzás jellemzi, mint Mezmerize-t, ami új hangzásvilágával osztotta meg a SOAD rajongókat, ugyanakkor nagyon hasonlít rá.

A Mezmerize/Hypnotize duplaalbum nagyon összetett. A legtöbb Mezmerize-on szereplő dalnak megvan a Hypnotize megfelelője is, ami hangzásvilágában és ritmusában megegyezik vele. Ezekre a számokra az avatott fül egyből ráismer. A két lemez együtt egyedi, ugyanakkor harmonikus hangzásvilágot ad. A két album összetartozását az is jól mutatja, hogy a Mezmerize első száma, a Soldier Side (Intro) tulajdonképpen egy felvezető a Hypnotize ugyanazon nevű utolsó számához. Ez egyfajta keretet ad a duplalemeznek.